Создавайте базовые версии
Под базовой версией в MSF подразумевается зафиксированное состояние любого проектного артефакта (а лучше всех одновременно) в том числе программный код, план проекта, руководства пользователя, настройки серверов и т.п. В последствии, имея базовые версии, вы сможете эффективно управлять изменениями, вернуться на шаг назад, если это необходимо и выполнять аналитику по завершению проекта.